为评估调整疫情防控措施之后奥密克戎毒株在境内的传播模式、有症状感染者中重症患者可能比例、以及此波疫情在大城市和中西部农村的走势,中国工程院院士、上海交通大学医学院附属瑞金医院、转化医学国家重大基础设施(上海)陈赛娟团队与上海市公共卫生临床中心范小红团队联合攻关,在Frontiers of Medicine发表研究论文《初步分析我国2022年秋冬新冠疫情中奥密克戎亚型多样性与流行病学特征》(Primary assessment of the diversity of Omicron sublineages and the epidemiologic features of autumn/winter 2022 COVID-19 wave in Chinese mainland)。
研究团队对2022年秋冬期间上海公卫中心收治的患者中随机抽取的378例样本进行基因组测序,发现主要毒株包括BF.7、BA.5.2和近期欧美地区出现的BQ.1及XBB,尚未发现新的新冠病毒变异株。
研究团队对2022年9月1日至2022年12月26日期间上海公卫中心收治的5706名有症状新冠病毒感染患者临床演变进行了分析,3.03%的患者发展为重症/危重症。
新冠病毒全基因组序列研究,95.95%的基因组序列集中在5个奥密克戎亚系。本文图片 交大医学院供图
研究结果提示:随着疫情演变带来的病毒传播途径的变化,多个奥密克戎亚型在国内同时传播,近期出现新冠病毒感染症状的人群中,重症主要集中在有基础疾病的老年人群体。元旦之后到春节期间,新冠疫情将主要影响农村和中小城镇地区。值得特别关注的是,国内农村和中小城镇地区医疗资源相对匮乏,且有大量老年人和有基础疾病人群,春运期间城市和农村人口流动性将极大影响疫情走向。
重症主要集中在有基础疾病的老年人群体
在论文中,研究团队对2022年秋冬期间上海公卫中心收治的患者中随机抽取的378例样本进行基因组测序,获得369个高质量新冠病毒全基因组序列。
研究分析发现,这些病毒基因组中共包含全球共享所有流感数据倡议(GISAID)数据库里记录的30个奥密克戎亚型毒株,其中355个(95.95%)基因组序列集中在5个奥密克戎亚系,主要毒株包括已报道在北京和广州等地流行的BF.7和BA.5.2和近期欧美地区出现的BQ.1和XBB。
结合感染者的旅行史和感染接触史,证明有北京或广州疫情接触史者分别主要携带BF.7和BA.5.2亚株;从海外入境上海的感染者主要携带BQ.1和XBB;而上海本地感染者中除了BA.5.2以外,还有多个奥密克戎亚株相对占比较高。这些结果中尚未发现新的新冠病毒变异株。
由于抗击新冠感染的任务已经转为防治重症为主,研究团队依据公开信息,对此波疫情截止到2022年11月29日的重症/危重症患者数和感染者总数变化情况进行分析,发现重症/危重症人数随感染者人数增长而增加,比例达到0.035%。
根据一般规律,高危人群在入院2-3周后演变为重症/危重症患者。研究团队对2022年9月1日至2022年12月26日期间上海公卫中心收治的5706名有症状新冠病毒感染患者临床演变进行了分析。
经过综合医学观察和诊断,其中5533名患者表现为轻型和普通型(总占比96.97%),其余173名患者进展成重症/危重症(总占比3.03%),其中包括20名仅有新冠感染者(0.35%)和153名伴有由新冠感染而加重的基础疾病患者(总占比2.68%)。此外年龄偏高者(55-60岁以上)和男性患者发展为重症/危重症的风险显著增高。
研究团队利用数学模型,初步预测奥密克戎疫情走向
研究预计元旦后至春节期间疫情主要影响农村和中小城镇地区
这一论文还利用数学模型,初步预测奥密克戎疫情走向。
基于此前北京、广州、上海、重庆等地常规核酸检测的感染者数据,这一研究建立模拟感染者数量变化曲线的数学模型,对近期疫情发展趋势进行评估和预测,初步判断此轮奥密克戎疫情感染人数于2023年元旦前后在上述主要城市趋于平缓。
然而,基于重庆市主城区和郊区数据的数学模拟分析,提示疫情峰值在郊区有所延后,且其感染峰值将在春运期间因疫情扩散加速而显著增强。
对于四川、陕西、甘肃、青海等省,在不计省会城市的地区对疫情进展情况进行预测,估计农村和中小城镇地区的感染峰值将于2023年1月中下旬出现,由于春运原因,这些峰值也可能提前到达。
研究团队分析结果提示:元旦之后到春节期间,新冠疫情将主要影响农村和中小城镇地区。值得特别关注的是,国内农村和中小城镇地区医疗资源相对匮乏,且有大量老年人和有基础疾病人群,春运期间城市和农村人口流动性将极大影响疫情走向。
因此,当前急需为奥密克戎疫情向农村地区扩散启动应急计划,将更多医疗资源配置到农村基层,做好有效药物和新型疫苗的应急使用许可,做好抗新冠病毒特异药物及辅助性药物、疗效确切的中药的生产储备、分配和临床合理使用。同时,要实施分类、分层治疗,加强中小城镇重症救治能力,继续精准用好非药物性公共卫生措施(在室内空间佩戴N95口罩、保持社交距离、公共交通工具适当增加班次以避免人群过于拥挤等),努力削减疫情峰值,缓解医疗系统和医务人员的沉重压力。
另外,研究团队认为,还要继续做好高危人群全程免疫接种,启动高风险人群的第四针免疫加强针接种;加强个人家庭防控知识技能普及,做好健康宣传和风险沟通,保护人民群众特别是困难群体的生命健康,确保我国平稳走出疫情,促进社会经济有序恢复发展。